고환암의 원인은 정확히 알려져 있지는 않으나 선천 혹은 후천 요인이 그 원인이 될 수 있습니다. 

선천 요인 중에는 잠복 고환이 가장 흔하며, 정상 피종은 잠복 고환과 관련된 고환암의 가장 보편적인 유형입니다. 음낭으로 내려오지 않은 고환은 점차적으로 퇴축되고 변성되어 종양으로 변하는데 그 이유는 명확하지 않으나 생식 세포 형태의 변화, 온도의 상승, 혈류 장애, 내분비 장애, 생식선의 이상 발육 때문인 것으로 알려져 있습니다. 

고환암의 과거력이 있는 경우, 아버지 또는 형제 중 고환암 가족력이 있는 경우 고환암 발생 위험이 높아집니다. 

후천 요인으로는 외상, 산모의 임신 중 여성 호르몬 투여, 고환 위축이 올 수 있는 화학 물질에 노출 또는 볼거리(유행 귀밑샘염; mumps) 바이러스 감염 등입니다.